У імунокомпетентних суб'єктів, в цілому, специфічного лікування токсоплазмозу не потрібно . Хвороба майже завжди спонтанно розсмоктується протягом декількох місяців; при необхідності можна застосовувати симптоматичну терапію.
У імунодепресованих індивідуумів і у вроджених формах лікування поєднанням піриметаміну та сульфадіазину, комбінованого з фоліновою кислотою (тобто 5-метил-тетрагідрофолат: фолієва кислота, перетворена в тетрагідрофолат і додану метильну групу), містить ризики пошкодження від антагонізму фолатів (включаючи мієлосупресію). Крім того, пацієнтам з окулярним токсоплазмозом слід призначати кортикостероїди.
Що стосується вагітної жінки з первинною інфекцією, лікування антибіотиками може зменшити ризик ураження плоду. Зокрема, спирамицин призначають, якщо токсоплазмоз скоротився протягом першого триместру (добре переноситься і без токсичності для плоду, оскільки він не перетинає плаценту) або комбінацією сульфадіазину, піриметаміну і фолінової кислоти. Ця остання терапевтична схема теоретично більш ефективна, якщо плід вже інфікований, але більш токсичний (піриметамін не повинен використовуватися протягом першого триместру, так як він тератогенний). Таким чином, лікування слід проводити під суворим медичним наглядом і вимагати постійного моніторингу кількості крові.
