В даний час не існує відповідної вакцини для запобігання лихоманці Марбурга . З цієї причини важливо приймати поведінку, спрямовану на уникнення зараження.
Зокрема, мандрівники, що подорожують до країни, де відбувається епідемія Марбурга, повинні суворо дотримуватися гігієнічних практик, таких як миття рук і уникнення дотику до предметів, які вступили в контакт з хворими або померлими людьми; у випадку раптового початку лихоманки, необхідно негайно звернутися до лікаря. Крім того, Всесвітня організація охорони здоров'я рекомендує не їсти м'ясо від диких тварин, таких як шимпанзе або мавпи.
Щоб уникнути передачі, всі підозрілі випадки вимагають суворої ізоляції в обладнаних приміщеннях і прийняття спеціальних процедур поводження, крім використання захисних пристроїв (маски, щитки для обличчя, халати й рукавички).
