Захисна активність чилі та його активний інгредієнт - капсаїцин - проти гастриту і виразкової хвороби продемонстровано кількома дослідженнями, аж до того, що сьогодні вивчається зв'язок капсаїцину з аспірином та іншими. НПЗЗ для зниження шкідливого впливу цих препаратів на слизову оболонку шлунка.
Деякі дослідження показують, що капсаїцин також має деяку антимікробну активність щодо бактерії Helicobacter pylori, основної причини виразкової хвороби і хронічного гастриту у людей. Ця активність була також продемонстрована на штамах Helicobacter pylori, резистентних до метронідазолу, і відповідає результатам деяких епідеміологічних досліджень; статистичні дані свідчать про те, що у певних популяціях, в яких широко застосовується гарячий перець, частота виразок шлунка нижча.
На підставі концентрацій, випробуваних in vitro, для отримання антибіотичних ефектів проти Helicobacter pylori, прийом гострого перцю повинен бути узгодженим (від 3 до 9 сирих перців на день залежно від вмісту капсаїцину); однак, слід зазначити, що на додаток до капсаїцину інші речовини, наявні в перцю чилі (фітокомплекс), можуть проявляти синергічну активність, знижуючи мінімальну ефективну дозу. Більш того, синергія з вродженими оболонками шлунка може додатково зменшити дозу чилі, достатню для усунення Helicobacter pylori з шлункового середовища.
Нещодавній огляд взаємозв'язку між вживанням чилі та раком шлунка (щодо якого є суперечливі дослідження), рекомендує помірне споживання капсаїцину, щоб повністю скористатися його потенційними перевагами без ризику. Проте, запрошення, що діє, особливо для тих популяцій (наприклад, мексиканського), де звичайне споживання перцю чилі та концентрації капсаїцину в споживаних сортах явно вищі, ніж італійські звички.
