Діагноз африканського трипаносомозу слід враховувати у всіх осіб, які залишилися в районах Африки, які вважаються ризикованими для захворювання.
Першу стадію сплячої хвороби важко діагностувати, оскільки вона викликає неспецифічні симптоми, такі як лихоманка і слабкість. Методи, які використовуються для прямої ідентифікації трипаносом, включають аналіз світлової мікроскопії зразків крові (мазка або товста крапля) або аспірація лімфатичних вузлів. Інші неспецифічні лабораторні дані показують панцитопенію, підвищену VES і ПЛР і підвищені рівні IgM.
Коли паразит проникає в центральну нервову систему і пацієнти починають проявляти неврологічні і психічні симптоми (погана координація рухів, дезорієнтація, судоми і порушення сну), діагностична оцінка вимагає аналізу зразка спинномозкової рідини . Дослідження ліквору дозволяє виділити трипаносоми і виділити високі рівні лімфоцитів, загальних білків, помітне збільшення IgM і характерні клітини Мотта (плазматичні клітини з цитоплазматичними вакуолями, що містять імуноглобуліни).
